43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1221 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
302 aa  586  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.04 
 
 
301 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  33.11 
 
 
303 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  33.55 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
320 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  31.13 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 
296 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  31.23 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  31 
 
 
295 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  27.4 
 
 
304 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  29.63 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27.63 
 
 
294 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  26.56 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  28.95 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  26.83 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  28.06 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  25.66 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  28.51 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  26.15 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  27.76 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  24.83 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  25.98 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  25.65 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  26.62 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  26.62 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  27.69 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  28.28 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  26.17 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  26.33 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  31.85 
 
 
298 aa  49.3  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  35.62 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.55 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 
315 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1593  hypothetical protein  24.07 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.435654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  24.48 
 
 
297 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  26.4 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  31.78 
 
 
324 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>