25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0807 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.48 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 
302 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  33.82 
 
 
297 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  29.14 
 
 
301 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  29.49 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 
296 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  28.67 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  28.33 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  29.23 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  28.28 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  30.85 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  26.58 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  26.53 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  25.24 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  27.51 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  27.83 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  20.57 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0292  hypothetical protein  32.09 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.379037  normal  0.0369953 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  24.67 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>