52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05113 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  577  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.12 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  36.51 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  34.77 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.13 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  34.58 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  30.1 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  29.27 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  30.6 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  29 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  32.22 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  26.51 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  27.95 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  29.35 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  29.01 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  28.1 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  30.57 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  28.23 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  28.94 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  27.82 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  25.91 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  27.01 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  25.49 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0408  hypothetical protein  22.01 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  27.73 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.02 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.75 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  22.59 
 
 		 312 aa  45.8  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.57 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.02 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  31.93 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.19 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.08 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.98 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.98 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.98 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.98 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.98 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.4 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.5 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.5 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.95 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>