55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1542 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  591  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.31 
 
 
301 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  46.49 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.65 
 
 
279 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.11 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  34.77 
 
 
296 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  32.99 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  31.4 
 
 
294 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  28.09 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  28.25 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 
320 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  30.74 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  29.53 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  28.04 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  31.45 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  28.88 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  27.82 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  27.55 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  27.2 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  26.47 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  25.08 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  26.06 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  24.67 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  31.67 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  26.14 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  42.47 
 
 
363 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0408  hypothetical protein  23.62 
 
 
292 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  26.16 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  22.98 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  31.85 
 
 
343 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  33.09 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.68 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  33.09 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.68 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1832  hypothetical protein  24.66 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  25.41 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  33.09 
 
 
290 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  26.47 
 
 
270 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  30.83 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  28.57 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.44 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.89 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0269  hypothetical protein  42.86 
 
 
583 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  25.35 
 
 
219 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  29.91 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0900  hypothetical protein  26.71 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1542  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.779421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  23.96 
 
 
296 aa  42.4  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>