38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1832 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1832  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  569  1e-161  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0667  hypothetical protein  31.7 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0639  hypothetical protein  30.84 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0834  hypothetical protein  28.7 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0535  hypothetical protein  28.29 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0292  hypothetical protein  27.89 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.379037  normal  0.0369953 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  25.81 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1440  hypothetical protein  27.14 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0416786  decreased coverage  0.00780704 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0460  hypothetical protein  31.77 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  25.34 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.39 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.14 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  33.04 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.78 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  26.38 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  33.04 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  23.95 
 
 
296 aa  47  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.27 
 
 
301 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  32.22 
 
 
341 aa  45.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.26 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  31.43 
 
 
299 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  30.85 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.03 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.22 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.47 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  29.05 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  24.29 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  30.3 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  23.63 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  30.34 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  22.61 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0537  hypothetical protein  26.63 
 
 
274 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0189141 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  23.08 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.54 
 
 
307 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  29.05 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  25.61 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>