25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1614 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0667  hypothetical protein  64.59 
 
 
270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0639  hypothetical protein  64.07 
 
 
268 aa  294  1e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0535  hypothetical protein  62.69 
 
 
273 aa  292  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0834  hypothetical protein  32.84 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1440  hypothetical protein  30.5 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0416786  decreased coverage  0.00780704 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0292  hypothetical protein  28.78 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.379037  normal  0.0369953 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0460  hypothetical protein  28.12 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0537  hypothetical protein  30.15 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0189141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.7 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.51 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  26.47 
 
 
303 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1832  hypothetical protein  25.71 
 
 
298 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1980  hypothetical protein  30.83 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.463491  normal  0.74257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.87 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.87 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  32.79 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  26.89 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  27.48 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  30.65 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  26.5 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  30.19 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  26.8 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.62 
 
 
299 aa  42  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  31.97 
 
 
292 aa  42  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>