17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0535 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0535  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  62.69 
 
 
270 aa  294  1e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0667  hypothetical protein  64.31 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0639  hypothetical protein  61.48 
 
 
268 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1440  hypothetical protein  36.89 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0416786  decreased coverage  0.00780704 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0834  hypothetical protein  32.71 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0460  hypothetical protein  32.82 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0292  hypothetical protein  28.78 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.379037  normal  0.0369953 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1832  hypothetical protein  27.84 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0537  hypothetical protein  33.66 
 
 
274 aa  48.9  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0189141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  27.84 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  27.06 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  27.06 
 
 
301 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  27.06 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  27.65 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  27.06 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  25 
 
 
293 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>