30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_12541 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 		 293 aa  567  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  46.91 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  46.13 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  37.96 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  35.89 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  35.54 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  34.8 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  32.99 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  33.9 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  33.22 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  29.77 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  29.66 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  32.99 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  30.85 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  28 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1440  hypothetical protein  26.13 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0416786  decreased coverage  0.00780704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  25.27 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  24.47 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  27.2 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  25.18 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  27.66 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.85 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  26.59 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>