40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00120 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  100 
 
 		 295 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  86.78 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  74.15 
 
 		 313 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  70.07 
 
 		 320 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  48.99 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  44.67 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  51.03 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.64 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  41.13 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  35.15 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  25.08 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  28.23 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27.97 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.22 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  31.06 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  23.26 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  26.35 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  25.18 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  20.67 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  20.67 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  20.67 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  20.67 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  20.67 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  21.23 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  20.11 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  20.67 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  22.69 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  48.78 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  20.11 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  21.23 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  38.6 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  18.75 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  29.31 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>