41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2183 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.1 
 
 
301 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  46.49 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.9 
 
 
279 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.72 
 
 
296 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  36.51 
 
 
296 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
302 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  33.67 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  30.85 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  33.68 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  34.41 
 
 
291 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  32.88 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  34.01 
 
 
290 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  32 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  26.23 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  27.03 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  28.62 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  27.53 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  27.53 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  27.4 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  26.77 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  26.35 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  25.47 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  27.01 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  28.28 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  25.11 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  26.94 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  36.13 
 
 
363 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  27.64 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  27.91 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  27.36 
 
 
320 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.56 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  27.75 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.27 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0408  hypothetical protein  27.08 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  29.58 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  28.12 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  29.58 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>