20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1217 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  541  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  61.36 
 
 
288 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  46.21 
 
 
293 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  36.43 
 
 
290 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  42.16 
 
 
288 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  36.8 
 
 
291 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  35.44 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  34.74 
 
 
288 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  34.94 
 
 
290 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  34.32 
 
 
290 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  29.29 
 
 
296 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  28.38 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 
301 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27.7 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  27.59 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  32.67 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  25.35 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>