34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15601 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  85.52 
 
 
290 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  89.31 
 
 
290 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  72.16 
 
 
291 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  45.58 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  46.13 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  45.58 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  33.9 
 
 
293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  33.7 
 
 
288 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  34.26 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  26.42 
 
 
296 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
301 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  25 
 
 
294 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  27.55 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  33.89 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  26.04 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  23.32 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  22.94 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  21.37 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  28.37 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.41 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.74 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  24.87 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  23.98 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0408  hypothetical protein  26.16 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  28.09 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  24.14 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  28.89 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  22.14 
 
 
298 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  24.31 
 
 
363 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>