40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4052 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  588  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  41.39 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.38 
 
 
297 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  40.07 
 
 
296 aa  185  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  40.26 
 
 
297 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  35.35 
 
 
295 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  35.15 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  35.12 
 
 
320 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  36.17 
 
 
313 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  39.53 
 
 
298 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  28.83 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  28.1 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  26.06 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  28 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  28.83 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  29.79 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  26.23 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  28.06 
 
 
304 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0292  hypothetical protein  25.17 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.379037  normal  0.0369953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  29.1 
 
 
304 aa  49.7  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.21 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.87 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0834  hypothetical protein  29.94 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.13 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  27.66 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  23.87 
 
 
310 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.98 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>