34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5722 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 320 aa  606  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  31.99 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  33.44 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  28.66 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  26.3 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  28.26 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  28.76 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  24.55 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  31.84 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  24.22 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  28.8 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  25.61 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  26.42 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  27.24 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  25.63 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  27.9 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.4 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  33.66 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  36.69 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  28.89 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  35.05 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1542  hypothetical protein  41.79 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779421 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  25.31 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.43 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  35.64 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>