46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0185 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 296 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  44.11 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  43.65 
 
 		 303 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.86 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  38.87 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.11 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  35.37 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  31.99 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.91 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  27.02 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  27.24 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.88 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  29.48 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  28.01 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  24.58 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  24.42 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  29.02 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  26.26 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  29.03 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  25.34 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  27.27 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  26.69 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  27.08 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  29.36 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  30.07 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  28.37 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  29.59 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  25.24 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  28.43 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  33.61 
 
 		 143 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  33.61 
 
 		 143 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  33.61 
 
 		 143 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1440  hypothetical protein  35.77 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0416786  decreased coverage  0.00780704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  30.95 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  32.47 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  28.12 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  29.07 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  25.1 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  25.1 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2406  DMT family permease  23.38 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>