77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0609 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  98.14 
 
 		 322 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  38.94 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.41 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  36.56 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  36.88 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  34.71 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  33.01 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  27.94 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  29.45 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  28.27 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  26.14 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  29.06 
 
 		 370 aa  92.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  23.81 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  26.48 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  26.83 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  25.45 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  26.67 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0999  hypothetical protein  24.1 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0570483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  25.86 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.93 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  29.52 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  37.5 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.09 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  24.88 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  24.76 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 303 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  22.42 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  23.2 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  36.27 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0432  hypothetical protein  25.69 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  35.29 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  27.88 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  24.5 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  35.29 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  35.29 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  24.25 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.49 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  35.79 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  24.63 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.86 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.14 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.15 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000436445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  25.64 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.01 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.59 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.01 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.01 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.59 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.59 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  26.79 
 
 		 288 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.59 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  21.4 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  23.58 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  22.86 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  26.37 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.18 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  24.38 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.65 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0640  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  21.37 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.15 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.18 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.31 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.63 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  24.04 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  35.06 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>