87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3006 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  276  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  276  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  276  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  88.81 
 
 		 144 aa  253  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  69.23 
 
 		 145 aa  197  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  69.5 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  71.83 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.09 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  63.31 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  63.31 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  64.03 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  62.77 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  62.14 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  60.58 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  56.93 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.31 
 
 		 145 aa  153  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.27 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  57.66 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  57.55 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.85 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  65 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.74 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  54.74 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  64.57 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  61.15 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.33 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.28 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.25 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.3 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  59.71 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  47.01 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  47.01 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  53.33 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.64 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.51 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  44.78 
 
 		 293 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  44.2 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.28 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.46 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.08 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.12 
 
 		 287 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.34 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.46 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  39.02 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  40.65 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  40.65 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  40.65 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  40.15 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  40.15 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.58 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  39.42 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  36.76 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.02 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.88 
 
 		 296 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  32.98 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  37.33 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  35.06 
 
 		 278 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.57 
 
 		 303 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  28.24 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  36.07 
 
 		 310 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  36.07 
 
 		 345 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 		 298 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  30.19 
 
 		 301 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  28.78 
 
 		 297 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  24.8 
 
 		 269 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  35.59 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  32.62 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 299 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.25 
 
 		 288 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>