93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7598 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  275  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  82.73 
 
 		 146 aa  201  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  68.35 
 
 		 146 aa  189  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  66.91 
 
 		 141 aa  183  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  65.96 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  66.91 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  59.72 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  72.99 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  60 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.36 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  60.43 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  58.99 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.99 
 
 		 143 aa  160  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.38 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  56.83 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.93 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  57.93 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.93 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  62.14 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  62.14 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  62.14 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.93 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  59.71 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.57 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  63.31 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  65.62 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  58.45 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  65.38 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  62.59 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  53.08 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  46.43 
 
 		 293 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  48.89 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.78 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.62 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  47.1 
 
 		 153 aa  110  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.9 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  44.29 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.5 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.75 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.22 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.98 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  41.01 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  41.73 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  40.29 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  40.29 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  40.29 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  40.29 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  40.29 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  40.29 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  40.29 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.43 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  40.29 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  40.29 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  37.4 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  37.86 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  37.86 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  37.14 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  34.03 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.43 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.97 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  34.13 
 
 		 730 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 		 298 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  32.14 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  34.74 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  27.01 
 
 		 291 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  30.6 
 
 		 349 aa  43.9  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  24.48 
 
 		 312 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  23.78 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  35.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  35.62 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  35.62 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06299  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07880)  34.67 
 
 		 691 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.68 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  35.62 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.34 
 
 		 300 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  25.53 
 
 		 307 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  34.29 
 
 		 309 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.07 
 
 		 309 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  28.85 
 
 		 302 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  36.07 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  35.44 
 
 		 275 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  35.59 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>