72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2587 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  274  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  96.5 
 
 		 143 aa  265  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  69.01 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  61.59 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  69.5 
 
 		 143 aa  174  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  69.5 
 
 		 143 aa  174  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  69.5 
 
 		 143 aa  174  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  67.63 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  58.99 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  58.96 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  61.03 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  60.29 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  60.29 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  57.25 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  59.42 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.52 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  58.7 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  54.07 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.59 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.07 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.29 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.33 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.3 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  51.47 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  55.88 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  47.79 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  59.84 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.78 
 
 		 138 aa  121  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.79 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  54.07 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  60.29 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  58.82 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.79 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  42.14 
 
 		 293 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  59.84 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.62 
 
 		 287 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.14 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  47.76 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  47.1 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.22 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.65 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.96 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.58 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  40.32 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.52 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  39.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  39.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  39.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  39.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  39.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  39.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  39.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  40.43 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  39.52 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  39.52 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  44.2 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  44.2 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  37.9 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.5 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  31.94 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  28.71 
 
 		 125 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  31.11 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  31.46 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  31.46 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 		 730 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>