96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6961 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 137 aa  258  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  83.82 
 
 		 137 aa  219  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  86.13 
 
 		 137 aa  203  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.8 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.8 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  56.2 
 
 		 137 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.15 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.47 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  54.01 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.21 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  47.06 
 
 		 293 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.18 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  51.47 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.01 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.52 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.73 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  47.06 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  48.51 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  120  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 		 287 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  50.75 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  47.01 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.15 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  50.75 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  47.79 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  51.15 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.15 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.17 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  52.59 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  50.43 
 
 		 142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  47.41 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  47.41 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  44.2 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 		 146 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  47.46 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  47.46 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  47.46 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  42.54 
 
 		 139 aa  103  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  45.95 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  46.28 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  42.75 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  42.03 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  37.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  37.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  37.82 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  37.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  37.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  37.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  37.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  37.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  39.5 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  53.47 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  39.5 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  39.5 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.82 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  34.43 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  33.07 
 
 		 302 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  33.07 
 
 		 302 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  30.26 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  31.11 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  34.72 
 
 		 311 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  34.72 
 
 		 311 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.67 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.92 
 
 		 285 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.68 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  32.28 
 
 		 302 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  32.28 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2682  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  32.35 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  35.29 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  29.37 
 
 		 311 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  31.5 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  31.5 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  31.5 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  34.07 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.13 
 
 		 307 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  26.47 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.71 
 
 		 364 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  35.94 
 
 		 158 aa  40  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  31.88 
 
 		 274 aa  40  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>