50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0424 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 137 aa  260  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  52.63 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.93 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.48 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.19 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.48 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.03 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  32.79 
 
 		 296 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  32.79 
 
 		 296 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  28.06 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 298 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  28.03 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  31.09 
 
 		 293 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  26.52 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.6 
 
 		 287 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.53 
 
 		 306 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  28.93 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  35 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  24.79 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  28.21 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  25 
 
 		 303 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  24.17 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  25.69 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  30.67 
 
 		 289 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.83 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  28.09 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  30.49 
 
 		 296 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  25.9 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  23.58 
 
 		 312 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.81 
 
 		 298 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 		 293 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  26.61 
 
 		 300 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  23.17 
 
 		 298 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  23.91 
 
 		 304 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.32 
 
 		 308 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>