28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1822 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  262  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  93.43 
 
 
137 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  246  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  75.2 
 
 
125 aa  194  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0568  hypothetical protein  54.4 
 
 
128 aa  91.3  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  31.82 
 
 
285 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  27.64 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  32.1 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  51.22 
 
 
308 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06299  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07880)  34.85 
 
 
691 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.38 
 
 
286 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  40.38 
 
 
286 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.38 
 
 
286 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0316  hypothetical protein  25.22 
 
 
301 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706595  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  40.38 
 
 
286 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  30.23 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0914  hypothetical protein  30.23 
 
 
289 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.684229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  25.38 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>