84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1377 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 160 aa  305  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.22 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  41.98 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.42 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.22 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  37.12 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.66 
 
 		 143 aa  90.5  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.13 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  38.85 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  42.15 
 
 		 293 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.09 
 
 		 138 aa  86.3  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  38.24 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.17 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.44 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  35.51 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.2 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  34.62 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  38.24 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.12 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  32.12 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  31.93 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  31.93 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  31.93 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  33.09 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  36.75 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  28.68 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  28.68 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  33.09 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  32.37 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  33.05 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  28.69 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  28.69 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  37 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  28.69 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.79 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  33.61 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  28.28 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  30.15 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  31.54 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  27.94 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  31.93 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  30.43 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  24.65 
 
 		 291 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 		 307 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  37.66 
 
 		 730 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0432  hypothetical protein  31.71 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30.88 
 
 		 313 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0071  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 		 299 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  26.62 
 
 		 289 aa  41.2  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  31.15 
 
 		 277 aa  40.8  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  27.41 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.1 
 
 		 303 aa  40.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>