30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0834 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  262  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  92.7 
 
 
137 aa  251  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  93.43 
 
 
137 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  75.2 
 
 
125 aa  190  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0568  hypothetical protein  54.4 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  31.06 
 
 
285 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  28.8 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  32.1 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  23.85 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0316  hypothetical protein  26.27 
 
 
301 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706595  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06299  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07880)  33.33 
 
 
691 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  25.52 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  48.78 
 
 
308 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  38.46 
 
 
286 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
286 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
286 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  28.26 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  38.46 
 
 
286 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>