79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3359 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
137 aa  261  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.12 
 
 
137 aa  189  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.97 
 
 
138 aa  186  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.99 
 
 
137 aa  173  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.8 
 
 
137 aa  168  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.93 
 
 
144 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  56.93 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  55.47 
 
 
137 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.88 
 
 
138 aa  155  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.45 
 
 
141 aa  144  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.74 
 
 
287 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.68 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  47.06 
 
 
293 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  49.26 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.47 
 
 
137 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.85 
 
 
145 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  47.79 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  46.32 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  48.53 
 
 
146 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.15 
 
 
143 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  47.76 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  47.76 
 
 
144 aa  116  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.09 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.11 
 
 
145 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  48.09 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  49.25 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  45.71 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  45.59 
 
 
142 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.17 
 
 
145 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  45.59 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  44.85 
 
 
142 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  48.51 
 
 
145 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  43.7 
 
 
139 aa  105  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  50.45 
 
 
145 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.79 
 
 
145 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  47.01 
 
 
144 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  46.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  46.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  46.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  46.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  46.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  46.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  46.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  45.38 
 
 
142 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  45.38 
 
 
142 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  45.38 
 
 
142 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  44.92 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  44.92 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  44.92 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  44.17 
 
 
146 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  45.65 
 
 
142 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  45.65 
 
 
142 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  44.93 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  46.61 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.1 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  46.61 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  47.66 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.84 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.28 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  32.33 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  32.58 
 
 
137 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  28.79 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
285 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  29.21 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  30.5 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  35.62 
 
 
291 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  34.62 
 
 
277 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>