29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1083 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  261  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  92.7 
 
 
137 aa  251  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  246  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  75.2 
 
 
125 aa  191  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0568  hypothetical protein  55.2 
 
 
128 aa  93.2  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  33.6 
 
 
285 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  29.37 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.68 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 
137 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  24.81 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  26.9 
 
 
306 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3725  hypothetical protein  24.49 
 
 
728 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06299  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07880)  34.85 
 
 
691 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  28.99 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  30.86 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  30.43 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  29.93 
 
 
315 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  34.04 
 
 
281 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  46.34 
 
 
308 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>