46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3783 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  100 
 
 
158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1107  hypothetical protein  35.82 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1107  hypothetical protein  36.09 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4070  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0387844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0316  hypothetical protein  29.06 
 
 
301 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706595  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  29.37 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  34.23 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  28.8 
 
 
137 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  31.2 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4726  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  27.64 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0335  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.59 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178446  normal  0.580514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4735  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 
140 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.172592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04960  integral to membrane protein, putative  41.79 
 
 
365 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 
287 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  29.23 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  27.15 
 
 
334 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  38.24 
 
 
279 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  28.57 
 
 
274 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  42.86 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  38.36 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 
137 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  32.05 
 
 
301 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1077  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.64 
 
 
136 aa  42  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.76 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  32.47 
 
 
301 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.33 
 
 
301 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  31.88 
 
 
137 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1709  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 
294 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  32.47 
 
 
301 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  32.47 
 
 
301 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  33.33 
 
 
283 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  32.47 
 
 
301 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.38 
 
 
295 aa  41.2  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  32.47 
 
 
301 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  32.47 
 
 
301 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.47 
 
 
301 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  33.75 
 
 
276 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
279 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>