42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04960 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE04960  integral to membrane protein, putative  100 
 
 		 365 aa  729    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16182  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73086  predicted protein  33.21 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392825  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01355  DMT family transporter (Eurofung)  34.17 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.592841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  29.79 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.45 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  29.37 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  29.37 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.66 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  28.21 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.66 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.28 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.85 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.47 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  32.91 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.06 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  25.34 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  30.15 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  24.22 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  24.11 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  24.11 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  31.54 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  41.79 
 
 		 158 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  24.25 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.56 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  30.15 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.85 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  25 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  25 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  27.91 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  27.59 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25 
 
 		 310 aa  42.7  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  29.29 
 
 		 273 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>