12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4923 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
137 aa  265  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  31.85 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1107  hypothetical protein  30.6 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1107  hypothetical protein  29.55 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4726  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.96 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4070  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.16 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0387844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0316  hypothetical protein  28.81 
 
 
301 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706595  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  35.37 
 
 
278 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  30.91 
 
 
278 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 
303 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  36.05 
 
 
285 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  23.13 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>