32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1787 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  55.21 
 
 
278 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  38.78 
 
 
281 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  42.55 
 
 
276 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  41.67 
 
 
278 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  37.04 
 
 
285 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  39.64 
 
 
279 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  48.9 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  48.9 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  48.9 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.31 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  37.01 
 
 
283 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.94 
 
 
279 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  38.7 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  44.3 
 
 
259 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.69 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3034  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.62 
 
 
280 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  34.07 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.49 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3545  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.33 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409938  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1340  hypothetical protein  28.4 
 
 
280 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0841167  normal  0.892969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 
137 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>