15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1340 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1340  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0914  hypothetical protein  47.54 
 
 
289 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.684229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  27.8 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  27.62 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  27.84 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0841167  normal  0.892969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  26.39 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>