16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0914 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0914  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.684229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1340  hypothetical protein  47.54 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  35.52 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  35.52 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  35.52 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  35.52 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  35.17 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  35.17 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  35.17 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  24.63 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  26.89 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  24.35 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0841167  normal  0.892969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  30.4 
 
 		 179 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.77 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>