More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1570 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  205  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  200  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  52.84 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  51.93 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  54.97 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 185 aa  181  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 184 aa  179  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50.85 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  53.14 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52.54 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  45 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 180 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  170  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  48.13 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  45.25 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>