More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1270 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  351  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  75.14 
 
 		 177 aa  273  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  204  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 179 aa  200  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  55.37 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  54.8 
 
 		 178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  193  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.98 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  53.22 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  55.06 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 177 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  53.26 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.12 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 		 183 aa  183  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  52.97 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  53.49 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 180 aa  181  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  54.86 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 176 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 181 aa  180  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>