More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0597 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  85.39 
 
 		 178 aa  306  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  78.77 
 
 		 179 aa  285  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  77.65 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  75.28 
 
 		 178 aa  271  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  75.98 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  72.63 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  73.03 
 
 		 178 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  74.44 
 
 		 180 aa  263  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  71.91 
 
 		 178 aa  263  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  69.1 
 
 		 178 aa  263  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  70.39 
 
 		 179 aa  260  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  73.18 
 
 		 179 aa  260  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  71.35 
 
 		 178 aa  259  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  72.78 
 
 		 180 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  70.39 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  70.39 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  70.39 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 180 aa  253  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  69.1 
 
 		 177 aa  250  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  70.39 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  68.54 
 
 		 178 aa  247  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  62.92 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  63.89 
 
 		 180 aa  227  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  61.24 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  64 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  63.24 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 179 aa  207  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 180 aa  207  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 178 aa  205  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 182 aa  204  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 180 aa  204  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.88 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  52.97 
 
 		 187 aa  198  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 180 aa  197  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  197  9e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  56.98 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  54.8 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  53.49 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  54.97 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  52.43 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  55.49 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  53.37 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  55.03 
 
 		 184 aa  187  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>