More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1337 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
179 aa  357  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  95.53 
 
 
179 aa  343  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  86.59 
 
 
179 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  86.59 
 
 
179 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  86.59 
 
 
179 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  84.92 
 
 
179 aa  315  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  79.33 
 
 
178 aa  295  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  76.54 
 
 
179 aa  290  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  75.42 
 
 
179 aa  279  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  72.63 
 
 
179 aa  270  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  69.83 
 
 
179 aa  270  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  70.39 
 
 
179 aa  266  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  69.83 
 
 
179 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  70.39 
 
 
179 aa  264  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  70.56 
 
 
180 aa  263  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  67.04 
 
 
179 aa  261  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  69.27 
 
 
179 aa  260  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  70 
 
 
180 aa  259  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 
178 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  65.36 
 
 
179 aa  255  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  67.6 
 
 
178 aa  255  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 
178 aa  254  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  69.27 
 
 
178 aa  253  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 
178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  64.25 
 
 
180 aa  249  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  65.92 
 
 
180 aa  248  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  63.13 
 
 
180 aa  246  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  65.36 
 
 
178 aa  244  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  66.67 
 
 
179 aa  243  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  65.36 
 
 
178 aa  240  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  63.89 
 
 
180 aa  240  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 
179 aa  235  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  62.57 
 
 
177 aa  234  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  63.69 
 
 
178 aa  234  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  59.22 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  61.29 
 
 
185 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  56.98 
 
 
180 aa  216  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56.42 
 
 
181 aa  209  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  56.67 
 
 
179 aa  208  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  57.95 
 
 
177 aa  202  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 
177 aa  200  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  54.3 
 
 
187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 
177 aa  197  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  53.11 
 
 
182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  52.81 
 
 
177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  193  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.07 
 
 
178 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  53.23 
 
 
187 aa  191  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
178 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  53.53 
 
 
185 aa  190  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  49.72 
 
 
180 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 
177 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 
177 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  52.25 
 
 
181 aa  189  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  187  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  52.25 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 
182 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  57.39 
 
 
177 aa  187  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  51.69 
 
 
177 aa  186  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  53.98 
 
 
177 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.33 
 
 
182 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 
181 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
178 aa  185  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 
179 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 
179 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  52.69 
 
 
187 aa  185  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 
177 aa  184  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 
177 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
178 aa  183  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  51.69 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  50.85 
 
 
177 aa  182  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  181  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 
177 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  52.91 
 
 
182 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  179  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  50.58 
 
 
183 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  52.35 
 
 
184 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 
179 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 
179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  50.82 
 
 
184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
177 aa  178  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 
177 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 
177 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>