More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2303 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  92.13 
 
 
178 aa  336  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 
178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  66.85 
 
 
178 aa  234  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  67.04 
 
 
179 aa  233  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 
178 aa  222  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  221  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  58.99 
 
 
180 aa  214  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  59.89 
 
 
177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 
176 aa  210  7e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  59.55 
 
 
179 aa  210  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  60.67 
 
 
178 aa  209  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  58.99 
 
 
179 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  56.74 
 
 
178 aa  207  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
179 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
178 aa  204  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
178 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 
180 aa  201  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  200  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.93 
 
 
179 aa  200  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 
179 aa  200  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
180 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  55.06 
 
 
177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  57.89 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 
178 aa  198  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  56.91 
 
 
181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  56.18 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  197  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 
177 aa  197  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 
180 aa  197  7.999999999999999e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  54.24 
 
 
179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.69 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 
182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
180 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  57.54 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  59.55 
 
 
179 aa  194  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
178 aa  193  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  57.65 
 
 
182 aa  193  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  193  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  192  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  55.87 
 
 
179 aa  192  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  55.31 
 
 
179 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.63 
 
 
179 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  191  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 
181 aa  191  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  53.07 
 
 
179 aa  191  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  51.96 
 
 
179 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  53.41 
 
 
182 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  56.14 
 
 
182 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 
182 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  56 
 
 
177 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  53.51 
 
 
187 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  187  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  187  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 
177 aa  186  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  185  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.4 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 
180 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 
187 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  55.68 
 
 
177 aa  182  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  51.41 
 
 
213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 
180 aa  181  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>