More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2033 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  353  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  99.44 
 
 		 180 aa  352  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  98.33 
 
 		 180 aa  348  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  86.67 
 
 		 180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  51.1 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  47.75 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  46.63 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  52.49 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 181 aa  174  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  49.16 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  48.04 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  47.7 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  45.25 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  46.07 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  44.69 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 180 aa  167  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  47.73 
 
 		 176 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  167  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  43.58 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  45.5 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  45.3 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  44.77 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  44.94 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  44.13 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  43.82 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  44.94 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>