More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1306 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  60.73 
 
 
179 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  60.73 
 
 
179 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  59.69 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  59.16 
 
 
179 aa  207  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  54.97 
 
 
179 aa  201  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  54.45 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  58.24 
 
 
182 aa  197  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
181 aa  197  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  54.45 
 
 
179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 
182 aa  195  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  51.83 
 
 
179 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.6 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52.63 
 
 
178 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 
178 aa  188  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  54.21 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  51.31 
 
 
178 aa  185  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  51.06 
 
 
177 aa  184  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  52.88 
 
 
179 aa  184  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  50.53 
 
 
178 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  51.31 
 
 
179 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.58 
 
 
178 aa  184  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  51.31 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  51.31 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.31 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  50.79 
 
 
179 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  50.79 
 
 
179 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  50.52 
 
 
180 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  49.47 
 
 
178 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  49.47 
 
 
178 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.05 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  50.53 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  50.26 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  50.79 
 
 
182 aa  180  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  50.26 
 
 
187 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  46.88 
 
 
180 aa  178  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  47.89 
 
 
178 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50.26 
 
 
179 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  48.95 
 
 
179 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  48.42 
 
 
178 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.31 
 
 
179 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  49.74 
 
 
179 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  48.95 
 
 
179 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  50.26 
 
 
179 aa  175  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  50.26 
 
 
179 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  50.26 
 
 
179 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  48.96 
 
 
180 aa  175  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48.95 
 
 
178 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  48.69 
 
 
179 aa  175  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  50.26 
 
 
179 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  51.31 
 
 
179 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  50.79 
 
 
179 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.17 
 
 
179 aa  174  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  48.69 
 
 
181 aa  174  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  48.69 
 
 
179 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  49.74 
 
 
179 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  48.69 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  47.64 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  48.69 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.21 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.31 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  48.69 
 
 
179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  49.21 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.52 
 
 
180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  46.88 
 
 
179 aa  171  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  49.74 
 
 
179 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  48.69 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  47.89 
 
 
178 aa  171  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  48.42 
 
 
178 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  48.17 
 
 
181 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  48.42 
 
 
178 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  48.7 
 
 
181 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 
179 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  47.89 
 
 
180 aa  168  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  48.96 
 
 
180 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  49.74 
 
 
179 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  48.96 
 
 
179 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  46.6 
 
 
179 aa  167  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  48.42 
 
 
179 aa  167  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  50.26 
 
 
179 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.42 
 
 
180 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  46.56 
 
 
180 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  47.18 
 
 
179 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  48.96 
 
 
180 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  48.69 
 
 
179 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  47.4 
 
 
179 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  47.64 
 
 
179 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  45.5 
 
 
180 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  45.03 
 
 
179 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  47.4 
 
 
179 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  47.87 
 
 
179 aa  166  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  45.5 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  47.89 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  47.59 
 
 
177 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  50.79 
 
 
179 aa  165  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  48.42 
 
 
178 aa  165  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>