More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1730 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
182 aa  358  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  70.22 
 
 
178 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 
178 aa  256  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  71.35 
 
 
183 aa  245  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  66.47 
 
 
182 aa  237  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  234  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  63.13 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 
180 aa  228  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  64.71 
 
 
184 aa  227  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  227  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  64.91 
 
 
183 aa  226  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  61.8 
 
 
178 aa  224  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  224  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  61.58 
 
 
179 aa  223  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 
179 aa  222  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  60.44 
 
 
182 aa  218  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  214  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 
178 aa  213  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  58.06 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  56.45 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  60.11 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  60.59 
 
 
183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  61.33 
 
 
181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  59.89 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  59.22 
 
 
179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  56.99 
 
 
187 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
180 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
180 aa  209  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  206  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 
178 aa  206  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  57.87 
 
 
179 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  56.18 
 
 
178 aa  205  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  56.98 
 
 
179 aa  204  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  57.3 
 
 
180 aa  204  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
178 aa  204  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
178 aa  204  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  56.18 
 
 
178 aa  203  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  57.54 
 
 
179 aa  203  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  55.31 
 
 
179 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
178 aa  202  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  58.76 
 
 
177 aa  201  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  55.87 
 
 
179 aa  200  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  200  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  200  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  55.49 
 
 
181 aa  198  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.67 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  54.24 
 
 
181 aa  197  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  57.22 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  57.71 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  55.31 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  54.4 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  52.81 
 
 
178 aa  194  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 
184 aa  194  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  55.87 
 
 
179 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  56.11 
 
 
180 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
180 aa  193  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  193  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  54.8 
 
 
177 aa  193  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
179 aa  192  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 
180 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 
180 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  53.67 
 
 
177 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  54.75 
 
 
179 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  191  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  59.17 
 
 
184 aa  191  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  56.18 
 
 
179 aa  191  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  190  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 
177 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  53.37 
 
 
178 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  49.43 
 
 
178 aa  189  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 
185 aa  189  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>