More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1852 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  63.13 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  60 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  56.5 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  54.75 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  58.29 
 
 		 177 aa  204  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.67 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  56.8 
 
 		 182 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  54.75 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.84 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  53.59 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 180 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  49.19 
 
 		 181 aa  184  8e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  51.96 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 187 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  52.07 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 180 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  53.26 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  51.76 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  51.18 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 179 aa  171  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>