More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3402 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  356  9e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  81.56 
 
 		 179 aa  299  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  81.56 
 
 		 179 aa  299  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  81.56 
 
 		 179 aa  299  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  79.33 
 
 		 179 aa  296  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  78.21 
 
 		 178 aa  291  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  77.65 
 
 		 179 aa  291  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  76.54 
 
 		 179 aa  290  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  72.63 
 
 		 179 aa  274  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  75.42 
 
 		 179 aa  273  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  71.51 
 
 		 179 aa  267  5.9999999999999995e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 179 aa  257  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  68.16 
 
 		 179 aa  254  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  68.72 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  69.27 
 
 		 180 aa  251  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  65.92 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 178 aa  248  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 178 aa  248  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  67.22 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 178 aa  245  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  67.04 
 
 		 178 aa  244  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  67.78 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  64.8 
 
 		 178 aa  241  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  70 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  66.67 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  62.57 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  63.69 
 
 		 177 aa  237  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 178 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  65 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  60.89 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  217  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  59.22 
 
 		 180 aa  217  7.999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  58.33 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  57.39 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  60.8 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  58.06 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 182 aa  198  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.63 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  56.11 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  57.78 
 
 		 181 aa  193  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  54.12 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  53.23 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 178 aa  189  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  54.07 
 
 		 182 aa  187  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  187  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  51.67 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  51.7 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  52.69 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  54.34 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  51.61 
 
 		 187 aa  181  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>