More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1264 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  81.92 
 
 		 177 aa  297  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  76.27 
 
 		 177 aa  287  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  230  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  64.41 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  220  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  217  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  203  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  187  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  57.39 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  51.43 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  52.54 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  51.43 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  49.14 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 180 aa  180  8.000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  55.11 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0489  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000497907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  50.86 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0409  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0384  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>