More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0276 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  100 
 
 		 181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  61.88 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  56.67 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 180 aa  201  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  55.68 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  56.73 
 
 		 182 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.63 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.54 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 184 aa  191  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 184 aa  191  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  48.65 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  53.04 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  55.19 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  53.04 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  52.46 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.07 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  48.11 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  48.11 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  49.15 
 
 		 180 aa  180  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 178 aa  180  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  51.14 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 183 aa  180  9.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>