More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0681 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  357  5e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  71.11 
 
 		 180 aa  265  2e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf426  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.88 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  49.19 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  50.58 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  51.16 
 
 		 182 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  51.16 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 180 aa  177  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.18 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  48.3 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0241  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 176 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  43.89 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 178 aa  173  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  46.11 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  46.11 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  46.63 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  46.63 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  44.89 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  43.82 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>