More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1081 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  356  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  77.65 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  77.09 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  75.98 
 
 		 179 aa  275  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  68.16 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  62.57 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  190  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 180 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 180 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.04 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 176 aa  185  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  51.96 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  53.23 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.4 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  54.65 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  55.23 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>