More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3990 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  357  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0504  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00191336  hitchhiker  0.0041563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  51.91 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.14 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 176 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1953  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 182 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  47.46 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  48 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  170  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 178 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>