More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2759 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  100 
 
 
179 aa  357  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  62.36 
 
 
178 aa  233  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 
178 aa  233  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  223  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  49.15 
 
 
177 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.12 
 
 
182 aa  187  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  184  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  184  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  50.57 
 
 
177 aa  184  7e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  183  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.85 
 
 
178 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 
178 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  50.26 
 
 
191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 
181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  50.56 
 
 
179 aa  181  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 
177 aa  181  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 
178 aa  179  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50.56 
 
 
180 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  48.88 
 
 
179 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  49.43 
 
 
178 aa  178  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  48.13 
 
 
187 aa  177  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 
178 aa  177  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  52 
 
 
177 aa  177  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  52 
 
 
177 aa  177  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 
179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 
179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
180 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 
179 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  49.72 
 
 
178 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  48.6 
 
 
179 aa  176  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  48.88 
 
 
179 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  52.51 
 
 
179 aa  175  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
178 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  52.07 
 
 
177 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 
184 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 
179 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 
179 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  174  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  48.88 
 
 
179 aa  174  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.19 
 
 
187 aa  174  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  47.28 
 
 
184 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  47.43 
 
 
177 aa  174  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.04 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  46.96 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  50.85 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  48.59 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 
179 aa  171  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 
180 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 
177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 
177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  44.38 
 
 
181 aa  170  7.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 
178 aa  170  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 
184 aa  170  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  48.88 
 
 
179 aa  170  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 
176 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  47.46 
 
 
178 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  50.6 
 
 
177 aa  169  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  48.52 
 
 
177 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 
178 aa  169  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  49.14 
 
 
175 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 
179 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>