More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2214 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  360  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  87.15 
 
 		 179 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  84.92 
 
 		 179 aa  317  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  75.98 
 
 		 179 aa  289  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 180 aa  276  8e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  267  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  191  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  52.72 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 182 aa  184  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 182 aa  181  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  49.15 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 176 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  49.15 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  50 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  47.75 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0771  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 174 aa  174  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.0130716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  174  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 178 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  174  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 176 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  46.89 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>