More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1338 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  76.27 
 
 		 177 aa  287  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  241  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  238  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  234  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  234  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  233  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  231  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  231  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  231  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  228  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  63.84 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  56.82 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  56.82 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  56.82 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  53.71 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  193  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 178 aa  190  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  55.37 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  52 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.43 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  53.14 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  47.46 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 178 aa  183  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>